Bonus
Galerie d'artworks
Terminer le jeu une fois et trouver un maximum d'amulettes.
Mode Difficile
Terminer le jeu une fois.
Mode Ninja Master
Terminer le jeu en Difficile.
Magasin de Muramasa
Terminer le jeu en Normal.
Jouer avec Momiji
Après avoir terminé le jeu en Normal, essayez de battre le dragon rouge avec Momiji à la fin du premier niveau pour débloquer le mode "The Way of Kunoichi". Pour y accéder, lancez une nouvelle partie. Le jeu sera plus difficile mais vous pourrez incarner Momiji.
Joyeux anniversaire
Réglez les paramètres de la DS sur la date de votre anniversaire, et vous entendrez une voix dire "happy birthday" lorsque vous lancerez le jeu.
Technique ultime
Pour diminuer le temps de chargement de la technique ultime (bleue puis rouge) et faciliter son exécution, vous devez vous efforcer de laisser les orbes en l'air le plus longtemps possible. Ryu ne les absorbe que lorsqu'il ne bouge plus. Plus il y aura d'orbes à l'écran, plus la technique s'exécutera rapidement. Vous pourrez alors quasiment les enchaîner sans interruption.
Réveiller Muramasa
Pour réveiller le vieil homme endormi, cliquez sur lui avec le stylet pour entendre ses ronflements, puis soufflez ou criez dans le micro.
Les amulettes
Il existe 45 amulettes dans le jeu, elles vous permettent de débloquer les bonus dans la section Récompenses qui devient accessible sur le menu principal après avoir terminé le jeu en Normal. Certaines amulettes sont cachées dans les 13 chapitres de l'aventure, d'autres s'obtiennent uniquement en recommençant le jeu en Difficile (Chef Ninja) et Très Difficile (Ninja Master), d'autres encore s'obtiennent en revenant dans les cercles jaunes qui apparaissent à chaque fois que vous terminez un niveau (il faut éliminer tous les monstres de la zone). L'amulette 45 s'obtient automatiquement après avoir obtenu les 44 autres.